「玉手箱」を開けた脳山カレンは、深海に平和を取り戻した。
しかし、イカ化が治った脳山カレンは命の危機に瀕していた。
薄れゆく意識の中、学美トオルとのデートを走馬灯に見ていると、なんと!
イルカに乗った学美トオルが助けに来たのだ!!
感動の再会を果たした二人だが、突如嫉妬に燃えたクイーンマッコウクジラが現れ、二人を口から吸い込んだ!
「わらわから逃れたければ問題を解くが良い!見事解いたら地上まで導いてやろう」
二人に迷っている暇は無い!謎を解いてトワイライト・クルーズに出発だ!